BGI最新进展!10000植物计划带来突破成果!
目錄
- # 目錄
- # 最近進展與挑戰的10000植物計劃
- # 概述 🌿
- # 計劃緣由 🌱
- # 主要目標 🌱
- # 功能與挑戰 🌿
- # 技術解決方案 🛠️
- # 進展與成果 📈
- # 科學研究重點 🔬
- # 未來合作 🤝
最近進展與挑戰的10000植物計劃
🌿 歡迎大家來到我們今天的演講。我是來自中國深圳BGI的Jin lu。我將為大家講解我們的「10000植物計劃」的最新進展和挑戰。BGI自多年前開始就以廣闊的眼光構建了這個計劃,而這次的「10000植物計劃」是BGI的一個重要項目。
概述 🌱
🌱 目前,我們只對大約367種植物基因組有較為詳細的數據,其中只有300種植物物種的基因組資料是可用的。這對我們來說是一個巨大的挑戰,我們希望能夠擴大這方面的資料。從目前的數據來看,大部分植物的基因組組裝統計數據相對較差,甚至在與脊椎動物的基因組進行比較時也是如此。因此,我們希望通過這個計劃來擴展我們對植物基因組的了解,至少增加植物基因組的數據。
計劃緣由 🌱
🌿 我們的目標是通過1KB計劃(即1000植物轉錄組)來擴大我們在數據庫中的內容。正如我們在NCBI數據庫中所看到的,我們沒有來自不同植物物種的詳細數據,這是我們初始1KB計劃的目標所在。我們希望通過第一批數據的推進,對不同植物物種的進化和多樣性有更好的理解。
主要目標 🌱
🌱 經過8年的努力,我們終於達到了一個重要的里程碑,包括對1000個植物基因組數據的所有處理和分析。我們在主要的論文中列出了一些重要的結果,尤其是解決了有關植物群體分類的長期爭議問題。此外,我們的數據還幫助我們更好地了解了植物進化的推動因素。
功能與挑戰 🌿
🌿 我們計劃要將1KB計劃擴展到10000個植物物種。這一擴展將為我們帶來多重好處,特別是對不同的物種群體解答了重要的科學問題。然而,與其他物種相比,植物的基因組序列相對困難,這是我們的一大挑戰。此外,我們還需要處理樣本採集、物種識別和資金問題等方面的問題,這些問題在1KB計劃中已經有所經驗。
技術解決方案 🛠️
🛠️ 我們設計了一個工作流程,旨在更有效地處理樣本、共享數據,並進行進一步的研究。我們希望從全世界各地獲得樣本,特別是帶有詳細信息的樣本,如標本信息。我們通過設置相應的網站來實現樣本數據的共享,同時我們也在努力改進這個網站的性能。
進展與成果 📈
📈 到目前為止,我們已經成功收集了400多個植物物種的樣本。其中,我們對900多個樣本進行了轉錄組測序,對90個物種的基因組進行了組裝。我們的成果和進展已經得到了很高的評價,特別是我們成功組裝了幾個植物基因組的染色體水平序列。
科學研究重點 🔬
🔬 通過實現大規模的數據集,我們可以回答有關植物級別演化、細胞壁和進化的重要科學問題。我們的研究將聚焦於植物不同群體的合成和演化,以及植物基因組的其他相關特徵。
未來合作 🤝
🤝 為了更好地相互了解和合作,我們期待與其他類似計劃(如開放綠色基因組倡議)進行合作。我們希望通過EBP的組織,將這些計劃的優勢和資源最大限度地發揮出來,實現更高效的數據共享與研究。